1970 yılında Sakarya İli Karasu İlçesi Taşlıgeçit köyünde doğdu. İlköğretimini aynı köyde okuduktan sonra İstanbul Yeşil Cami Kur’an Kursunda Hafızlığını ve 1989 yılında Sakarya İmam-Hatip Lisesini bitirdi.
Mezun olduktan sonra Sakarya Merkezde kısa bir süre Müezzin-Kayyım olarak çalıştı. 1989 yılında El Ezher Üniversitesi İlahiyat Fakültesine başladı ve bu okuldan da 1993 yılında mezun oldu. 1994 yılında Sakarya-Karasuda İmam-Hatip olarak göreve başladı. Aynı yıl Aralık ayında askere gitti. İzmit-Gölcükte kısa dönem olarak askerliğini tamamlayarak, 1996 yılında Diyanet İşleri Başkanlığına bağlı İstanbul Haseki Eğitim Merkezinde ihtisasa başladı. 1998 yılında kursu başarı ile tamamlayarak Bursa-Karacabey İlçe Müftülüğüne Vaiz olarak atandı.
1998 yılında görevde yükselme sınavına girerek Müftülük müktesebini aldı. Ardından; Burdur İli Altınyayla İlçesine Müftü olarak naklen atandı. Burada 4 yıl süre görev yaptıktan sonra Almanya’ya din görevlisi olarak gitti. 2007 yılında buradaki görevini tamamlayarak yurda döndü. Temmuz ayında Artvin İl Müftü Yardımcısı olarak göreve başladı.
23/07/2010 – 28/01/2011 tarihleri arasında Bursa İli Orhangazi, 10.02.2011 12/09/2014 tarihleri arasında da İstanbul İli Ümraniye İlçe Müftülükleri görevinde bulunan Ercan AKSU, 16/09/2014 tarihi itibarıyla Gümüşhane İl Müftüsü olarak görevine başlamıştır. Evli ve 3 çocuk babası olup, iyi derecede Arapça ve Almanca bilmektedir.